SSF:在重复诊断测试中样品量和频率计算的网络应用
前言
监测疾病状态的重复性诊断试验是疾病监测的一个关键部分。尽管我们知道它的重要性,但对于采样频率和重复测验的样本量这个常见问题,工作还做得很少。本文介绍一个叫SSF(样品量和频率)的网络应用,全新的网络应用框架构建的网络应用程序。在他们选择的设计方案基础上,SSF提供易于使用和即时显示样品数量和频率的计算结果。
材料和方法
SSF是一种用R语言编程的全新的网络应用软件。SSF运用框架为重复诊断试验样品量和频率提供快速便捷的运算。例如,当我们用SSF改变一个设定的参数值,比如流行率,表格和绘图结果会立刻更新以反映新的设定。SSF一般由爱荷华州立大学提供的服务器管理。和其他闪光应用相似,SSF由3个主要的UI组成,配置平板,表格平板,结果平板,如图表1所示。平板结构位于左侧列。考虑到各种各样的参数这个平板可以调整。右边平板顶端是表格平板,包含两个标签,各自与表格和图表对应。右边平板底部是结果平板,包括根据挑选的配置选项和标签做的结果分析。
图1 SSF屏幕截图,表格式结果
结果
配置平板允许使用者输入参数计算样品量和频率。参数包括流行率、期望检测时间和期望的探测功率。例如,如果使用者指定一个参数,检测一个14天内流行率0.1的疾病,期望功率为0.95,样品量和频率组合立刻被计算出并展示在表格(图1)或绘图(图2)中。
图2 样本大小VS结果频度绘图截面
结论和讨论
利用R语言和光明框架网络应用,在重复的诊断试验中SSF可以快速方便的计算出样品量和频率。可以足够灵活的调查多种多样不同的文库方案,肽链长度和文库大小。但是,这个应用是以网络为基础的,并且易于使用的,也方便用于其他领域的统计资料。
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